Beberapa isomer lain antrakuinon boleh terhasil seperti 1,2-, 1,4- dan 2,6-antrakuinon. Mereka mempunyai kepentingan yang agak kecil. Istilah ini juga digunakan dalam erti kata yang lebih umum bagi mana-mana sebatian yang boleh dilihat sebagai antrakuinon dengan beberapa atom hidrogen digantikan oleh atom lain atau kumpulan berfungsi. Derivatif ini termasuk bahan yang berguna secara teknikal atau memainkan peranan penting dalam makhluk hidup.

Baru-baru ini, kelas derivat antrakuinon telah ditunjukkan mempunyai sifat penyembuhan diri apabila didop dalam matriks PMMA.[11]